尊龙凯时

尊龙凯时与宁波大学隶属第一医院相助，综合较量靶向下一代测序（tNGS）手艺与CTs在临床诊断中的作用，对380例患者的肺泡灌洗液举行了回首性剖析。

研究效果显示：tNGS的检测效果与最终临床诊断总一致率达83.02%，远高于CTs的38.37%；tNGS还乐成识别出67%的混淆熏染病例，以“细菌+病毒”共熏染最为多见（40.7%），明确了CAP与sCAP保存特征性差别的病原谱组成。该研究效果已揭晓于国际权威期刊《Frontiers in Microbiology》（IF=4.5）。

论文宣布截图

CAP是一种由细菌、真菌和病毒等病原体熏染引起的常见熏染性疾病，进一步生长为sCAP后，其症状越发严重，可能引起器官衰竭或危及患者生命，给医疗系统带来了重大肩负^[1]。作为一类常见的由重大微生物熏染引起的急性下呼吸道熏染疾病，其临床体现规模普遍，从体现为发热和恳蛟的轻度肺炎，到可能生长为败血症或急性呼吸衰竭的重度肺炎，症状可能与其他疾病保存重叠，导致难以实时区分，同时，熏染病原识别准确率低，广谱抗生素的太过使用，给肺炎的诊断和治理带来了挑战^[2-3]。

《急诊成人社区获得性肺炎临床实践指南（2024年版）》指出，2016-2019年，住院CAP患者的年平均发病率为187/10万，其中sCAP约占CAP患者的13.58%~20.05%^[4]。近年来，CAP院内病死率在0.8%~2.1%，而sCAP院内病死率高于2.49%，病死率陪同年岁增添而升高，其中65岁以上CAP患者，病死率可达5.7%^[4]。

社区获得性肺炎的诊断和治疗依赖于快速识别^[2,5]。临床古板病原微生物检测要领（CTs），如形态学检测、疏散作育及药敏、免疫学或核酸检测等，在临床上普遍使用，具有一定的诊断敏感性和特异性，仍保存一定的局限性^[6-7]。

靶向下一代测序（tNGS）是一种准确且快速的分子病原体检测要领，在坚持较高检测迅速度的同时，笼罩数百种常见临床病原体，可同步检测耐药基因^[3,8,9]。tNGS通过严酷的引物或探针设计，构建了涵盖大大都常见临床病原体的检测规模，可应用于多种临床样本类型^[3]。

早期确定sCAP患者的熏染病原，有利于指导抗菌药物的使用，改善患者的病死率^[6]。因此，接纳更有用的要领作为新工具辅助肺炎诊断成为现在临床生长的趋势。

本研究是一项回首性研究，患者群体凭证临床综合诊断效果分组，CAP及sCAP诊断标准基于《急诊成人社区获得性肺炎临床实践指南》与《美国熏染病学会/美国胸科学会关于成人社区获得性肺炎治理的共识指南》举行，最终纳入380例患者（CAP295例，sCAP85例）。

所有患者均同时接受tNGS（尊龙凯时泛熏染靶向高通量测序，笼罩431种病原体，同步检测耐药/毒力基因）和CTs（细菌/真菌作育、抗酸染色、Gram染色、PCR等）举行检测。

针对CTs与tNGS在临床下呼吸道病原诊断历程中的一致性、CAP/sCAP熏染病原谱差别、熏染模式差别，以及差别检测要领与临床诊断效果比照一致性举行了比照和研究，以评估tNGS在社区获得性肺炎希望历程中可以起到的诊断作用。

图1：实验设计概述及患者入组流程图。

tNGS共检出86种差别病原体，其中CAP患者的熏染以病毒和细菌为主，而sCAP患者的熏染主要为细菌和真菌熏染。

CAP患者检出病原TOP5划分是：人类疱疹病毒4（EBV，44.75%），人类疱疹病毒7（HHV-7，38.98%），流感嗜血杆菌（24.75%），肺炎链球菌（14.92%）和耶氏肺孢子菌（10.51%）；sCAP患者检出病原TOP5划分是：鲍曼不动杆菌（37.65%），肺炎克雷伯菌（31.76%），铜绿假单胞菌（27.06%），白色念珠菌（27.06%）和人类疱疹病毒4（EBV，25.88%）。

图2：380份样本中病原体的检出频率。病原体检出频率较量（左侧为CAP，右侧为sCAP）。病原体分为三组：病毒组、真菌组和细菌组。

CAP/sCAP患者群体中，最主要的熏染模式为混淆熏染。67%的患者为混淆熏染（n=254/380），其中细菌与病毒的组合共熏染率最高，达40.7%（n=155/380）。

凭证病原交织熏染模式对常见熏染病原组合举行了评估，最常检测到的病原体组合是EBV和HHV-7。其次常见的组合是流感嗜血杆菌和EBV。

EBV是本研究中最多检测到的病原体，它在全球约90%的成年人中普遍漫衍^[10-11]。在康健人群中，EBV大多处于潜在状态，而因EBV引起熏染类疾病的患病率，陪同着人的年岁增添而逐渐升高^[11]。EBV和HHV-7的保存通常纷歧定作为肺炎熏染的活跃病因，然而，思量到本研究纳入患者平均年岁为62岁，因年岁增添引起的免疫朽迈或共病导致的病毒熏染，值得进一步关注。

在tNGS与CTs的一致性评估中视察到显著差别。比照效果显示，在380个样本中，4%（n=17）的检测效果在tNGS和CTs之间完全一致，28%（n=108）部分一致，67%（n=254）完全纷歧致。

一致性较量显著差别主要是由要领学差别性造成。CTs在手艺限制下保存局限性，以作育法为例，部分病原作育周期过长，部分病原难以作育，以至于在作育周期内无法获得有用作育效果。免疫学剖析及PCR要领受限于取样部位，取样时间与手艺限制，迅速度，特异性和检测规模也会受到滋扰。相比之下，tNGS受到这些因素的影响较小，能够通过核酸富集降低检出限，同时检测规模较广，能够检测到越发富厚的病原体。

综合完全一致与部分一致（不影响临床诊断）的效果，作为检测要领与临床诊断之间一致的评估，tNGS与临床诊断之间的一致性显著高于CTs与临床诊断之间的一致性（83.02%vs38.37%，p<0.05）。在与临床诊断完全一致的较量中，CTs略高于tNGS，是由于tNGS检测到的定植菌与低载量病原不作为致病性缘故原由。而部分一致（不影响临床诊断）的较量中，tNGS远高于CTs，是由于CTs的局限性导致可检测病原的检测规模、检出限、特异性的局限性，从而导致无法检出部分致病病原。

该研究效果富厚了tNGS在下呼吸道熏染中的应用证据，明确了tNGS在病原检出率、混淆熏染识别及临床诊断一致性方面的优势，同时展现了CAP与sCAP在病原谱组成上的实质差别。

研究效果提醒，tNGS可作为CAP/sCAP病原诊断的敏感辅助工具，但其检测效果的标准化解读、定植菌与致病菌的判别仍需团结临床体现与通例检测综合判断。

尊龙凯时将一连推动tNGS手艺在熏染性疾病精准诊疗中的临床转化应用，为抗熏染治疗的个体化决议提供更周全的分子诊断支持。